顺应潮流:仅血浆ctDNA-MRD验证的应用前景!

2022-01-24 06:43:45 来源:
分享:

"组蛋白被纳入MRD探测的潜力是指明的,想这些的发展将独自提很低更早先MRD探测的安全性。"

乳腺癌的MRD探测是一种速度快且特异的用于系统对乳腺癌患儿肾脏中都会源性有机体(如ctDNA)比较数量的步骤。在这种状态下,患儿不能肉眼可见的恶性肿瘤,但或许发挥作用新标准医讲授影像步骤无法探测到但最终都会导致乳腺癌开刀的非常大恶性肿瘤。

MRD,常称为非常大渗入恶性肿瘤(Minimal Residual Disease)。使用“Minimal” (非常大)这个词语,是因为它在文献和医讲授专家中都会愈来愈典型。不过,“Minimal”这个词语不太可能很强“误导性”,因为长时间的原发性在常为节病和放射治疗执行者之外也不太可能很强不可或缺意义。“Measurable”(可测量)一词语可愈来愈吻合地说明了渗入在病人体内的免疫细胞的发挥作用。NCCNGuide同时使用了“Minimal Residual Disease”(非常大渗入恶性肿瘤)和“Measurable Residual Disease”(可测量渗入恶性肿瘤)两个术语。

此外,可行性深入研究表明在水分子准确度上探测多种乳腺癌子类的ctDNA或多或少很强医讲授效用,文献和医讲授专家有时也都会使用“Molecular Residual Disease”(水分子渗入恶性肿瘤)一词语。

近年来,国内外在单独中都会基于ctDNA的MRD不太可能都会评估(ctDNA-MRD)的医讲授信息和迹象日益多,敞开了单独肉瘤MRD探测的波澜。单独肉瘤ctDNA-MRD探测的高效率学派主要有两大类:

1)Tumor-informed assays(知情分析步骤)

对原发组织起来顺利完成测序以鉴定患儿的特异原核生物变异研究成果,然后内部设计引物定制panel或使用固定panel顺利完成个性化的ctDNA探测分析步骤。

2)Tumor-uninformed assays(责怪分析步骤)

也可以称为Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays,即不必原发组织起来,至少缺少各别先选定引物/探针内部设计的与乳腺癌子类相关的固定panel顺利完成ctDNA探测分析步骤,常在探测ctDNA变异的同时,先以ctDNA组蛋白或视频组讲授等多组讲授步骤。弥补了组织起来样本不足或系统对肽链不足或TAT较宽等问题。

Tumor-informed assays的高效率作法愈来愈符合标准大众的认知,在保证很低抗体的年前提下,可通过系统对多肽链的sample-level(样本准确度)必要性提很低其阈值,高效率投票率比较大不是特别很低。Tumor-uninformed assays的高效率作法愈来愈类似于更早滴,通过提很低site-level(肽链准确度)探测阈值并先以ctDNA组蛋白或视频组讲授并紧密常为合机器讲授习搜索算法必要性提很低其阈值和抗体,高效率投票率比较大较很低。

2021年4月底29日,《Clinical Cancer Research》在线发表了“至少使用血红蛋白ctDNA探测常为乳腺癌患儿非常大渗入恶性肿瘤(MRD)”的文章,首次引起争议了Guardant Reveal的深入研究信息:MRD探测阈值约到91%,抗体约100%,这些发掘借助于支持了至少血红蛋白ctDNA-MRD探测(Tumor-uninformed assays)的潜在医讲授高效率的发展。

2021年8月底13日,《Clinical Cancer Research》在线发表了“顺应潮流:至少血红蛋白ctDNA-MRD探测的高效率的发展脆弱性”的文章,在这里深入历史讲授者们讨论不太可能都会评估了至少血红蛋白ctDNA探测MRD的意志力,以及将组蛋白为基础到ctDNA探测的潜在效用。2

Parikh及其熟人1 和Taieb及其熟人3 讨论了至少血红蛋白ctDNA-MRD探测在常为乳腺癌(CRC)患儿中都会的潜在医讲授高效率的发展。

▲ ctDNA组蛋白和变异在两项深入研究中都会的高效率的发展较为(Parikh和Taieb)

常为乳腺癌(CRC)的放射治疗依然陷于着一个挑战,即或多或少的CRC患儿因更早期疾病开刀而过更早死亡。尽管医讲授选用了新标准的借助于放射治疗,但很低不太可能都会IIIC期CRC患儿的5年生存率也至少有53%,正因如此是不能发掘借助于影像讲授上未探测到的非常大渗入恶性肿瘤(MRD)。4

现有,仍迫切并不才可要吻合确认哪些患儿术后发挥作用MRD,以帮助聘请降低或增大借助于放射治疗,并增大绝症的更必要性,同时最大限度地降低避免放射治疗的相关毒性。

在过去的几年里,我们对ctDNA在CRC诊断和常为节病中都会的高效率的发展有了广泛高效率的发展的了解。现有,基于ctDNA的MRD不太可能都会评估正广泛高效率的发展使用乳腺癌的放射治疗中都会。

ctDNA是由DNA的短视频组成(分之一130-150bp),由免疫细胞通过衰老、炎症或排泄释放到肺脏中都会。 ctDNA的半衰期较宽致使其成为敏感的实时负荷一个大,它的发挥作用不太可能反映了影像讲授上看不到的纤移到。

在绝症性放射治疗常为束后,ctDNA中都会消失的体细胞变异对随后的影像讲授开刀很强较很低的阴性分析经济效益,特别是当这些变异与开刀的组织起来中都会的变异相匹配时。探测这种ctDNA界定的MRD可以在I-III期CRC中都会提年前影像讲授数月底分析开刀,从而为各别最终都会开刀的CRC患儿备有一个不太可能都会评估新疗法的过道。然而,这些ctDNA政治体制变异界定的MRD探测步骤的阈值依然是有限的,迫切并不才可要改进型其探测安全性。

ctDNA的组蛋白探测胜过ctDNA的政治体制变异探测。ctDNA的组蛋白极度在CRC中都会非常典型,并被视为大多数癌变的更早期阶段。这种组蛋白,说明界定为DNA中都会胞嘧啶的C5左边去除烷基基团,调节周围DNA的表约,还包括经典的抑癌DNA失活。与政治体制变异相较,CRC中都会发挥作用愈来愈多的组蛋白极度区域,为提很低MRD探测的阈值备有了机都会。SEPT9,就是第一个来进行肾脏探测单原核生物蛋白极度顺利完成滴查和更早期探测CRC的步骤。尽管ctDNA组蛋白有这些优点,但这些相同的特性也并不才可要谨慎,以保持探测分析步骤的抗体,并尽量降低;也阴性的更必要性。

在这种氛围下,Parikh和Taieb的这两项同类型深入研究常为果为我们对ctDNA安全性的明白备有了有用的足量,即不必原发组织起来,至少通过肾脏ctDNA组蛋白或倡议ctDNA变异才可顺利完成吻合的MRD不太可能都会评估。与其他并不才可要对原发组织起来顺利完成测序以聘请后续ctDNA分析步骤的探测相同,这两项深入研究探讨了Tumor-uninformed assays的有效性,它有几个优势,还包括快速的TAT,增大初始成本,对组织起来不足或不能不用的患儿顺利完成系统对。

Parikh等人备有了一种ctDNA组蛋白紧密常为合ctDNA政治体制变异的固定panel顺利完成MRD的分析步骤不太可能都会评估(NGS步骤),与其他商业活动上最非常简单的MRD探测步骤相较,这种步骤不并不才可要开刀的组织起来以及定制化。在最终放射治疗后使用时,这种至少血红蛋白ctDNA-MRD探测对开刀很强医讲授意义的抗体(100%)和阈值(55.6%),通过为基础表观原核生物基本特征和侧向系统对分析步骤,其阈值可必要性提很低至91%。1 该步骤被用于正在顺利完成的年前瞻性深入研究,还包括聘请IIA期常为肠癌放射治疗执行者的NRG协力组深入研究(NCT04068103)。虽然还并不才可要额外的信息集来验证这些发掘借助于,但这些常为果显然了基于ctDNA的MRD探测在责怪的情况下可不感兴趣的探测安全性基本特征。

Taieb等人的深入研究来进行了一对当初被显然是CRC开刀后常为节病相关的组蛋白DNA标记物WIF1和NPY(ddPCR步骤),并将它们使用PRODIGE-GERCOR IDEA-France试验,将III期CRC患儿随机分别为3个月底 vs 6个月底的借助于化疗。在对参加III期试验的III期CRC患儿顺利完成的首次ctDNA-MRD不太可能都会评估中都会,有13.8%的患儿术后为ctDNA-MRD阴性,并被获知为独立的常为节病一个大。3 同时,深入历史讲授者也指借助于,与其他选用NGS步骤的ctDNA-MRD深入研究相较,本深入研究中都会ctDNA的阴性率较低。阈值和PPV或多或少低于NGS探测常为果,ctDNA-MRD阴性和阴性的5年DFS分别为65%和73%,尽管借助于放射治疗的和不理想的年前分析步骤样本处理都会对这些常为果产生影响。该步骤值得注意的是其比较非常简单,非常低的成本和潜在的复原性,不并不才可要商业活动探测中都会所见的专利高效率探测步骤。正在顺利完成的年前瞻性深入研究将必要性不太可能都会评估至少血红蛋白ctDNA探测应该需要吻合不太可能都会评估MRD,以便对CRC患儿顺利完成不太可能都会分层,并聘请借助于放射治疗执行者。

无论选用何种步骤,至少用血红蛋白ctDNA-MRD探测来聘请CRC患儿的放射治疗提议,并不才可要可靠且吻合的探测步骤。才可必要性提很低至少血红蛋白ctDNA-MRD探测的阈值来确认哪些患儿可以从放射治疗降级中都会获益,以避免不恰当地选择很低危患儿不感兴趣较低强度的放射治疗。Parikh及其熟人的深入研究常为果表明,为基础原核生物和表观原核生物以及侧向血红蛋白系统对,可相当大提很低至少血红蛋白ctDNA-MRD的阈值。相较之下,ctDNA-MRD探测的很低抗体对于ctDNA作为一个完整的生物一个大来确认放射治疗升级是至关不可或缺的。由于抗体不足,;也阴性的ctDNA-MRD都会使患儿不感兴趣避免的强化放射治疗。Parikh及其熟人的深入研究常为果显然,除政治体制变异外,还可以通过紧密常为合表观原核生物组蛋白基本特征的分析步骤来保持抗体。Taieb等人的分析步骤步骤的优势在于提很低了医讲授基本特征的阈值和常为节病,但是,正如深入历史讲授者拒绝不感兴趣的那样,单独的两个原核生物蛋白标记不太可能无法备有与紧密常为合政治体制变异步骤的安全性基本特征。不可或缺的是,这项工作也强调了新简化分析步骤年前条件的不可或缺性,因为各种提取步骤可以在更大程度上影响ctDNA的得率和完整性。在未来的深入研究中都会,这些分析步骤年前的考虑将变得日益不可或缺。

组蛋白被纳入MRD探测的潜力是指明的,想这些的发展将独自提很低更早先MRD探测的安全性。总之,至少血红蛋白ctDNA-MRD的探测备有了一个独特的机都会,使用一种无创步骤来探寻放射治疗提案,并意味著根绝很低危患儿的纤移到性恶性肿瘤。这些深入研究常为果无疑为未来ctDNA-MRD聘请的年前瞻性抗病毒坚持不懈了道路。

MRD,依然是一个快速发展的领域,我们预计近两年都会消失最初迹象,要么显示借助于MRD探测的医讲授效用的值得注意,要么显示借助于MRD探测的其他优势和新用途。

请注意:

1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.

3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.

分享: